靶向基因組編輯

CRISPR-Cas9 圖示生成器

使用 CRISPR-Cas9 圖示生成器，創建清晰的基因編輯機製圖。可呈現目標 DNA 解鏈、單導 RNA（sgRNA）間隔序列雜交、Cas9 核酸內切酶結構域切割，以及雙鏈斷裂後的修復路徑。

sgRNA 間隔序列與骨架PAM 5'-NGG 識別可編輯 SVG 與 PPTX適用於期刊排版

CRISPR-Cas9 圖示生成器

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三步生成 CRISPR-Cas9 圖示

繪制基因工程圖示，準確標注核酸酶結構域、靶序列雜交及後續 DNA 修復路徑，並在使用前核對科學內容。

指定引導 RNA、PAM 和靶位點

說明 Cas 酶變體（SpCas9、SaCas9、Cas12a）、20 nt 間隔序列、PAM 基序（5'-NGG）及目標基因組位點。

檢查核酸酶切割和修復機制

核對 HNH 和 RuvC 切割箭頭、R-loop 結構，以及 NHEJ 敲除或 HDR 定點插入等修復分支。

匯出可編輯向量圖用於發表

下載分層 SVG 圖形或原生 PowerPoint（PPTX）幻燈片，以調整核苷酸字型、蛋白配色和面板佈局。

指定引導 RNA、PAM 和靶位點

說明 Cas 酶變體（SpCas9、SaCas9、Cas12a）、20 nt 間隔序列、PAM 基序（5'-NGG）及目標基因組位點。

檢查核酸酶切割和修復機制

核對 HNH 和 RuvC 切割箭頭、R-loop 結構，以及 NHEJ 敲除或 HDR 定點插入等修復分支。

匯出可編輯向量圖用於發表

下載分層 SVG 圖形或原生 PowerPoint（PPTX）幻燈片，以調整核苷酸字型、蛋白配色和面板佈局。

CRISPR-Cas9 圖示示例

查看可編輯科學圖示，涵蓋 Cas9 核糖核蛋白結構、PAM 識別、核酸酶切割和精准鹼基編輯。

Cas9 RNP 復合物與結構域組成

展示雙葉結構的 Cas9 核酸內切酶，包括 REC 識別葉、NUC 催化葉、橋螺旋和 sgRNA 骨架的相互作用。

Cas9 RNP

PAM 識別與 R-loop 形成

展示原間隔序列鄰近基序（5'-NGG）結合後局部 DNA 解鏈，以及 20 nt 引導間隔序列與靶序列雜交。

5'-NGG-3' PAM

HNH 與 RuvC 核酸內切酶切割

展示 HNH 與 RuvC 在 PAM 上游 3 bp 處協同切割目標鏈和非目標鏈，形成平端雙鏈斷裂。

HNH

NHEJ 敲除與 HDR 定點插入修復

對比易出錯的 NHEJ 所產生的插入缺失，與 HDR 以模板為指導實現的高保真定點插入。

NHEJ

鹼基編輯與先導編輯系統

展示工程化切口酶融合蛋白，包括胞嘧啶/腺嘌呤鹼基編輯器（CBE/ABE）和逆轉錄酶先導編輯器（PE2/PE3）。

Base Editor

體內遞送與驗證讀出

對比 AAV 載體和脂質納米顆粒等遞送方式，以及 NGS 和 GUIDE-seq 脫靶驗證方法。

AAV

為何選擇 SciDraw

研究人員為何選擇 SciDraw 繪制 CRISPR 圖示

SciDraw 可用於起草科學圖示。使用前請依據來源資料核對標籤、關係與主張。

工作需求	SciDraw AI	通用影像生成工具
呈現雙葉蛋白結構	可呈現 REC 識別葉、NUC 催化葉和橋螺旋；請依據已發表的結構資料核對圖示。	無法區分 Cas9 的 REC/NUC 結構域與 sgRNA 髮夾骨架，常渲染為無結構色塊。
標注 PAM 與切割位置	圖示可保留 DNA 鏈 5' 到 3' 的方向，並標注 PAM 上游 3 bp 的切割位置；使用前請對照目標系統核對。	切割位點隨意放置，缺乏 5'-NGG-3' PAM 對齊與 R-loop 雙鏈解旋細節。
匯出向量圖和 PowerPoint 幻燈片	下載 SVG 或可編輯 PPTX 幻燈片，以調整核苷酸字符、顏色和線條粗細。	輸出靜態像素圖，無法修改鹼基序列或結構域標籤。
按許可和期刊規則使用圖示	付費方案允許依據 SciDraw 許可進行商業使用，但仍受適用法律、第三方權利和期刊披露要求限制。	授權範圍不透明，不便用於論文投稿與基金申請合規核查。

實用指南

CRISPR-Cas9 機製圖繪制實用指南

遵循科學可視化原則，提升圖示的準確性和可讀性，並對照目標期刊的最新投稿要求進行檢查。

1. Cas9 核酸內切酶與引導 RNA 的結構

CRISPR-Cas9（來源於化膿性鏈球菌的 II 型 CRISPR 系統）依靠核糖核蛋白（RNP）裝置協同工作。為發表而繪制系統結構時，應準確呈現各個組成部分：

雙葉結構：Cas9 多肽折疊為兩個主要結構葉，中間由帶正電的橋螺旋連接：α 螺旋豐富的識別葉（REC）和核酸酶葉（NUC）。
NUC 催化結構域：NUC 葉包含兩個不同的核酸內切酶中心：HNH 切割互補的目標 DNA 鏈，RuvC 切割被置換的非互補鏈。
單導 RNA（sgRNA）結構：工程化 sgRNA 由 20 nt 的靶向間隔序列和長度超過 80 nt 的反式活化 crRNA（tracrRNA）骨架組成，後者形成三個莖環結構。
PAM 識別：C 端 PAM 互作結構域（PID）與非目標鏈上的 5'-NGG-3' 原間隔序列鄰近基序結合，啓動局部雙鏈解旋。

2. DNA 雙鏈斷裂修復：NHEJ 與 HDR

完整的 CRISPR 機製圖通常需要呈現 Cas9 造成雙鏈斷裂（DSB）後，目標基因組位點在細胞中的後續命運：

非同源末端連接（NHEJ）：常見於不分裂細胞和哺乳動物體細胞。Ku70/Ku80 與 DNA-PKcs 募集到斷端並直接連接，過程中常產生小片段插入或缺失（indel），可能導致閱讀框移位並造成基因敲除。
同源定向修復（HDR）：主要在細胞週期 S 期和 G2 期活躍。Rad51 介導鏈侵入，並利用外源供體模板（ssODN 或雙鏈質粒）實現精確序列替換或標籤插入。
替代技術：應區分標準雙鏈斷裂切割與切口酶介導的鹼基編輯（CBE/ABE 脫氨反應）和先導編輯（pegRNA 指導的逆轉錄酶合成）；後兩者可繞過有意造成的雙鏈斷裂，以減少 indel。

3. 同行評審稿件中 CRISPR 圖示的報告規範

學術期刊要求準確標注目標基因組序列、脫靶對照和圖示製作軟體的使用情況：

序列標注：在 DNA 兩條鏈上標明 5' 至 3' 方向，並用對比鮮明的顏色突出 PAM 三核苷酸序列。
切割位點標記：相對於 PAM，在 -3 和 -4 位點之間用清晰的垂直剪刀符號或虛線標示預計切割位置。
方法部分披露：可在稿件中說明：‘CRISPR-Cas9 機製圖和靶向示意圖使用 SciDraw AI（SciDraw，https://scidraw.org）生成，並根據目標位點測序數據進行了核對。’ 請按期刊政策調整披露方式。
可重復性核對：確保圖中所有 sgRNA 間隔序列與補充方法表中列出的寡核苷酸序列一致。