細胞降解與溶酶體

自噬路徑圖生成器

使用自噬路徑圖生成器,創建清晰、便於期刊排版的科學圖示。可分層呈現吞噬泡、LC3-II 脂化、自噬體形成和溶酶體融合過程,並匯出可編輯向量圖。

吞噬泡成核LC3-II 脂化SNARE 介導的融合可編輯 SVG 與 PPTX

自噬路徑圖生成器

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三步生成自噬路徑圖

將分子機制和細胞路徑整理為清晰、便於核對的科學圖示,為同行評審期刊投稿做好準備。

1. 指定路徑複合物、關鍵酶與細胞區室

輸入上游刺激訊號、蛋白質複合物、輔因子及胞器膜邊界等核心生物學要素。

2. 核對方向箭頭與正負調控邏輯

對照實驗數據與文獻,檢查活化箭頭、抑制橫槓、跨膜轉位及反饋迴路是否準確。

3. 匯出分層 SVG 向量圖或可編輯 PPTX

下載分層 SVG 向量檔案或 PowerPoint 投影片,自由調整蛋白標籤、字級與配色。

精選自噬路徑圖示例

查看使用 SciDraw AI 創建的高資訊密度科學圖示。可匯出為 SVG 和 PPTX 繼續編輯。

經典巨自噬路徑

展示經典巨自噬中的吞噬泡成核、延伸、自噬體閉合和溶酶體融合。

ULK1/VPS34

PINK1-Parkin 線粒體自噬級聯

展示 PINK1-Parkin 介導的線粒體自噬,包括線粒體去極化、泛素標記和選擇性降解。

PINK1

伴侶介導的自噬(CMA)

展示 Hsc70 識別 KFERQ 基序,以及底物通過 LAMP2A 轉位進入溶酶體的伴侶介導自噬過程。

Hsc70

mTORC1 與 AMPK 自噬調控開關

展示代謝能量感知調控:營養充足時 mTORC1 抑制自噬,飢餓時 AMPK 活化 ULK1。

mTORC1

異噬與病原體清除

展示異噬路徑中細胞內細菌的選擇性泛素化,以及 p62/SQSTM1 介導的包裹過程。

Xenophagy

SNARE 與 HOPS 介導的自噬體融合

展示自噬體與溶酶體融合過程,包括 STX17、SNAP29、VAMP8 的反式 SNARE 配對及 Rab7 募集。

STX17/SNAP29
為何選擇 SciDraw

為什麼科研人員選擇 SciDraw AI 繪制自噬路徑圖

SciDraw 可用於起草科學圖示。使用前請依據來源資料核對標籤、關係與主張。

工作需求
SciDraw AI
通用影像生成工具
科學實體與蛋白複合物呈現
規範排布經典蛋白複合物、磷酸化位點與清晰可讀的基因/蛋白命名。
常生成不存在的蛋白結構、虛構基因符號或難以辨認的偽文字。
生化箭頭語義與細胞區室邊界
嚴格區分活化箭頭(→)、抑制橫槓(⊣)以及胞器膜拓撲邊界。
箭頭方向隨意,缺乏胞器膜邊界及明確的正負調控區分。
SVG 與 PowerPoint 後期可編輯性
支援匯出分層 SVG 向量圖與包含獨立可編輯文字方塊的 PowerPoint(PPTX)投影片。
僅輸出扁平化像素圖,文字拼寫錯誤或排版問題無法直接修改。
適配期刊配圖與學術報告輸出
原生支援 16:9 寬螢幕構圖、2K/4K 匯出,並可一鍵銜接科研影片摘要動畫。
畫幅比例不穩定且解析度偏低,往往需要在其他軟體中重新繪製。
實用指南

自噬路徑圖繪制與發表指南

遵循科學可視化原則,提升圖示的準確性和可讀性,並對照目標期刊的最新投稿要求進行檢查。

自噬體與溶酶體融合圖,展示 STX17、SNAP29、VAMP8 反式 SNARE 配對和 Rab7 募集

自噬通量中的關鍵生化復合物

嚴謹的自噬路徑圖應清楚區分上游營養感知調控層(mTORC1 和 AMPK)與下游結構裝置。可突出 ULK1 激酶核心復合物(ULK1、ATG13、FIP200、ATG101)在內質網 omegasome 啓動成核的作用,並呈現 class III PI3K 復合物(VPS34、Beclin-1、ATG14)生成 PI3P 脂質平台的過程。

  • 起始復合物:ULK1、ATG13、FIP200、ATG101
  • 成核平台:VPS34、Beclin-1、ATG14、VPS15 生成 PI3P
  • 泛素樣連接系統:ATG12–ATG5–ATG16L1 復合物及 LC3-PE 脂化
  • 融合裝置:STX17–SNAP29–VAMP8 SNARE 復合物、Rab7 和 HOPS 復合物
經典巨自噬路徑圖,展示吞噬泡成核、延伸、自噬體閉合和溶酶體融合

細胞降解過程的圖示規範

Autophagy、Cell 和 Nature Cell Biology 等同行評審期刊要求清楚區分細胞質前體形式(LC3-I)與脂質結合、位於膜上的形式(LC3-II)。繪制雙層膜吞噬泡時可使用典型的彎月形結構,並區分貨物包裹過程與內體、多泡體之間的交互。

  • 用兩條清晰的膜線區分未成熟吞噬泡和閉合的自噬體
  • 使用含義明確的箭頭表示酶促脂化和分子募集級聯
  • 標出 mTORC1 在 ULK1 Ser757 位點磷酸化對應的抑制線
  • 用不同符號表示 p62/SQSTM1、NBR1 和 OPTN 等選擇性自噬受體
異噬路徑圖,展示細胞內細菌的選擇性泛素化和 p62/SQSTM1 介導的包裹

期刊投稿前核對清單

在圖注中寫出所有縮寫的全稱。確認溶酶體酸性水解酶(cathepsin B、D、L)位於單層膜自噬溶酶體內部,環境 pH 為 4.5–5.0;並確認氨基酸、脂肪酸等代謝回收產物通過相應轉運蛋白進入細胞質。

  • 核對膜結構:自噬體為雙層膜,溶酶體和自噬溶酶體為單層膜
  • 核對自噬通量標誌物(LC3-II 累積和 p62 降解)是否與實驗 Western blot 結果一致
  • 確保文字對比度充足,在單欄(85 mm)和 1.5 欄(120 mm)印刷寬度下仍易讀
PINK1-Parkin 介導的線粒體自噬圖,展示線粒體去極化、泛素標記和選擇性降解

4. 面向期刊投稿與學術報告的多格式匯出與排版最佳化

同一張路徑或機製圖常需兼顧論文雙欄配圖、16:9 學術會議投影片及基金申請書。合理規劃視覺層級,可確保在不同媒介下均保持清晰可讀:

  • 匯出分層 SVG 向量圖或原生 PPTX 投影片,根據目標期刊或會場螢幕靈活調整字級、箭頭粗細與配色方案。
  • 在多面板組合圖中保持一致的色彩編碼,使上游刺激、活性複合物與抑制劑一目了然。
  • 在正式投稿或報告前,對照原始實驗數據與權威文獻核對所有基因符號、修飾位點與因果箭頭。

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感言

為什麼研究人員在他們的工作流程中保留 SciDraw

研究人員、研究生和教育工作者分享 SciDraw 如何幫助他們更快地建立科研配圖、科研配圖、圖文摘要 (Graphical Abstract)和更清晰的教學視覺效果。

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海倫·萬斯博士

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細胞生物學教授

當學生要求提供教科書之外的力圖示例時,我會開啟 SciDraw,而不是在簡報投影片上重新繪製一個。這是我首先使用的科研配圖生成器,然後我快速檢查每個向量。

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物理教師

對於資助提案,我們在任何人開始完善科學資料之前使用 SciDraw 就實驗設定圖達成一致。它減少了來回的次數,並從第一天起就為團隊提供了共享的視覺效果。

德文德拉·維爾馬博士

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研究實驗室主任

在確定一個之前,我可以比較一些生物訊號路徑圖作為學習筆記。

阮明

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理科研究生

在我的論文中,我從 SciDraw 中的神經通路和突觸佈局開始從手稿到圖形的過程。它為我提供了強大的第一構圖,因此我可以將插畫師的時間花在重要的細節上。

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第一張科研配圖紙讓我們的分餾設計審查立即啟動。

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如果庫存影像與該周的氣候主題不匹配,我會在 SciDraw 中製作一個快速圖表。它為全班提供了適合討論的視覺效果,我可以根據他們的水平定製標籤。

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趙美玲教授

環境科學教育家

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