生物化学与细胞代谢

代谢通路图生成器

使用代谢通路图生成器,创建清晰的科学图示,呈现糖酵解、TCA 循环、氧化磷酸化、Warburg 有氧糖酵解及变构调节的限速酶。

糖酵解与 TCA 循环Warburg 有氧糖酵解限速酶节点可编辑 SVG 与 PPTX

代谢通路图生成器

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三步生成代谢通路图

将分子机制和细胞通路整理为清晰、便于核验的科学图示,为同行评审期刊投稿做好准备。

1. 指定通路复合物、关键酶与细胞区室

输入上游刺激信号、蛋白质复合物、辅因子及细胞器膜边界等核心生物学要素。

2. 核验方向箭头与正负调控逻辑

对照实验数据与文献,检查激活箭头、抑制横杠、跨膜转位及反馈回路是否准确。

3. 导出分层 SVG 矢量图或可编辑 PPTX

下载分层 SVG 矢量文件或 PowerPoint 幻灯片,自由调整蛋白标签、字号与配色。

精选代谢通路与能量流向图示示例

查看使用 SciDraw AI 起草的科学图示,可导出为 SVG 或 PPTX 继续编辑。

经典糖酵解、TCA 循环与氧化磷酸化

展示葡萄糖转化为丙酮酸、TCA 循环及线粒体氧化磷酸化过程。

Glycolysis

Warburg 效应:癌症中的有氧糖酵解

展示癌细胞中的 Warburg 效应,包括 LDHA 上调、PKM2 二聚体及经 MCT1/4 输出乳酸。

Warburg Effect

谷氨酰胺分解与 TCA 补充反应网络

展示谷氨酰胺分解和补充反应,包括 ASCT2 摄取、GLS1 脱酰胺及 α-酮戊二酸补充。

Glutaminolysis

磷酸戊糖途径(PPP)与 NADPH

展示磷酸戊糖途径氧化支路中 G6PDH 生成 NADPH 和核糖-5-磷酸的过程。

PPP

脂肪酸合成与 β-氧化

对比脂肪酸从头合成与线粒体 β-氧化,呈现柠檬酸穿梭和 CPT1 限速步骤。

ACC1/FASN

一碳叶酸与甲硫氨酸循环

展示一碳代谢中的叶酸和甲硫氨酸循环,以及 SHMT、MTHFR 和 SAM 甲基化平衡。

Folate Cycle
为何选择 SciDraw

为什么科研人员选择 SciDraw AI 绘制代谢通路图

SciDraw 可用于起草科学图示。使用前请根据来源材料核对标签、关系和主张。

工作需求
SciDraw AI
通用图像生成工具
科学实体与蛋白复合物呈现
规范排布经典蛋白复合物、磷酸化位点与清晰可读的基因/蛋白命名。
常生成不存在的蛋白结构、虚构基因符号或难以辨认的伪文字。
生化箭头语义与细胞区室边界
严格区分激活箭头(→)、抑制横杠(⊣)以及细胞器膜拓扑边界。
箭头方向随意,缺乏细胞器膜边界及明确的正负调控区分。
SVG 与 PowerPoint 后期可编辑性
支持导出分层 SVG 矢量图与包含独立可编辑文本框的 PowerPoint(PPTX)幻灯片。
仅输出扁平化像素图,文字拼写错误或排版问题无法直接修改。
适配期刊配图与学术汇报输出
原生支持 16:9 宽屏构图、2K/4K 导出,并可一键衔接科研视频摘要动画。
画幅比例不稳定且分辨率偏低,往往需要在其他软件中重新绘制。
实用指南

科学图示与投稿指南

遵循科学可视化原则,提升图示的准确性和可读性,并对照目标期刊的最新投稿要求进行检查。

经典糖酵解和 TCA 循环图,展示葡萄糖转化为丙酮酸及线粒体氧化磷酸化

能量流向:从糖酵解到氧化磷酸化

规范的代谢通路图需要平衡化学细节与视觉可读性。可展示糖酵解的 10 个连续步骤,并突出三个不可逆的限速酶:己糖激酶(HK)、磷酸果糖激酶-1(PFK-1)和丙酮酸激酶(PKM)。还可呈现丙酮酸经丙酮酸脱氢酶(PDH)转化为乙酰辅酶 A,随后碳进入线粒体三羧酸(TCA)循环的过程。

  • 糖酵解的能量投入与回收:呈现 HK、PFK-1 消耗 ATP,以及 PGK、PKM 生成 ATP 的过程
  • 氧化还原辅因子计量:呈现 NAD+ 还原为 NADH,以及经苹果酸-天冬氨酸穿梭再氧化的过程
  • TCA 循环酶调控节点:柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶(IDH)和 α-酮戊二酸脱氢酶(α-KGDH)
  • 连接电子传递链:电子传递至复合物 I 和 II,建立驱动 F0F1 ATP 合酶的质子梯度
Warburg 效应图,展示癌细胞中 LDHA 上调、PKM2 二聚体和 MCT1/4 介导的乳酸输出

癌症代谢重编程与 Warburg 效应

肿瘤学和免疫学研究常展示代谢适应。在常氧条件下,增殖中的肿瘤细胞和活化免疫细胞可能减少丙酮酸的线粒体氧化,将其经乳酸脱氢酶 A(LDHA)转化为乳酸,再通过单羧酸转运蛋白(MCT1、MCT4)输出。具体变化因细胞类型和实验条件而异。

  • PKM2 亚型变化:低活性的 PKM2 二聚体可能使糖酵解中间产物转入分支合成通路
  • 磷酸戊糖途径(PPP):葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PDH)生成 NADPH,参与谷胱甘肽还原和脂肪酸合成
  • 谷氨酰胺代谢:SLC1A5/ASCT2 和谷氨酰胺酶 1(GLS1)表达上调可能通过补充反应补充 α-酮戊二酸
谷氨酰胺分解和 TCA 补充反应图,展示 ASCT2 摄取、GLS1 反应和 α-酮戊二酸补充

期刊图示中的生化标注与矢量编辑

Cell Metabolism、Nature Metabolism 和 Molecular Cell 等期刊对化学中间体和酶标签有具体规范。代谢物名称应使用标准写法,ATP/ADP、NADH/NAD+ 等辅因子应保持计量关系;限速酶及其变构激活剂和抑制剂也应清楚呈现。请以目标期刊最新指南为准。

  • 使用清晰的节点区分:代谢物可用圆形或胶囊形节点表示,酶可用方框文字或标注箭头表示
  • 用颜色区分分支通路:例如以蓝青色表示糖酵解、绿色表示 TCA、琥珀色表示脂质合成、紫色表示 PPP
  • 准确区分可逆和不可逆反应,并用单向或双向箭头标示
磷酸戊糖途径图,展示 G6PDH 氧化支路生成 NADPH 和核糖-5-磷酸

4. 面向期刊投稿与学术汇报的多格式导出与排版优化

同一张通路或机制图常需兼顾论文双栏配图、16:9 学术会议幻灯片及基金申请书。合理规划视觉层级,可确保在不同媒介下均保持清晰可读:

  • 导出分层 SVG 矢量图或原生 PPTX 幻灯片,根据目标期刊或会场屏幕灵活调整字号、箭头粗细与配色方案。
  • 在多面板组合图中保持一致的色彩编码,使上游刺激、活性复合物与抑制剂一目了然。
  • 在正式投稿或汇报前,对照原始实验数据与权威文献核验所有基因符号、修饰位点与因果箭头。

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感言

为什么研究人员在他们的工作流程中保留 SciDraw

研究人员、研究生和教育工作者分享 SciDraw 如何帮助他们更快地创建科研配图、科研配图、图文摘要 (Graphical Abstract)和更清晰的教学视觉效果。

对于植物细胞讲座,我需要在不重建旧幻灯片的情况下调用叶绿体和液泡。 SciDraw 为我提供了一个有用的科研配图布局,仅经过几次标签编辑后就进入了我的幻灯片。

海伦·万斯博士

海伦·万斯博士

细胞生物学教授

当学生要求提供教科书之外的力图示例时,我会打开 SciDraw,而不是在幻灯片上重新绘制一个。这是我首先使用的科研配图生成器,然后我快速检查每个向量。

哈维尔·奥尔特加博士

哈维尔·奥尔特加博士

物理教师

对于资助提案,我们在任何人开始完善科学数据之前使用 SciDraw 就实验设置图达成一致。它减少了来回的次数,并从第一天起就为团队提供了共享的视觉效果。

德文德拉·维尔马博士

德文德拉·维尔马博士

研究实验室主任

在确定一个之前,我可以比较一些生物信号通路图作为学习笔记。

阮明

阮明

理科研究生

在我的论文中,我从 SciDraw 中的神经通路和突触布局开始从手稿到图形的过程。它为我提供了强大的第一构图,因此我可以将插画师的时间花在重要的细节上。

安纳尼亚·拉奥博士

安纳尼亚·拉奥博士

博士生·神经科学

第一张科研配图纸让我们的分馏设计审查立即启动。

马库斯·戴维斯博士

马库斯·戴维斯博士

化学工程主管

如果库存图像与该周的气候主题不匹配,我会在 SciDraw 中制作一个快速图表。它为全班提供了适合讨论的视觉效果,我可以根据他们的水平定制标签。

赵美玲教授

赵美玲教授

环境科学教育家

FAQ

常见问题

代谢通路图生成器 | SciDraw