细胞降解与溶酶体

自噬通路图生成器

使用自噬通路图生成器,创建清晰、便于期刊排版的科学图示。可分层呈现吞噬泡、LC3-II 脂化、自噬体形成和溶酶体融合过程,并导出可编辑矢量图。

吞噬泡成核LC3-II 脂化SNARE 介导的融合可编辑 SVG 与 PPTX

自噬通路图生成器

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三步生成自噬通路图

将分子机制和细胞通路整理为清晰、便于核验的科学图示,为同行评审期刊投稿做好准备。

1. 指定通路复合物、关键酶与细胞区室

输入上游刺激信号、蛋白质复合物、辅因子及细胞器膜边界等核心生物学要素。

2. 核验方向箭头与正负调控逻辑

对照实验数据与文献,检查激活箭头、抑制横杠、跨膜转位及反馈回路是否准确。

3. 导出分层 SVG 矢量图或可编辑 PPTX

下载分层 SVG 矢量文件或 PowerPoint 幻灯片,自由调整蛋白标签、字号与配色。

精选自噬通路图示例

查看使用 SciDraw AI 创建的高信息密度科学图示。可导出为 SVG 和 PPTX 继续编辑。

经典巨自噬通路

展示经典巨自噬中的吞噬泡成核、延伸、自噬体闭合和溶酶体融合。

ULK1/VPS34

PINK1-Parkin 线粒体自噬级联

展示 PINK1-Parkin 介导的线粒体自噬,包括线粒体去极化、泛素标记和选择性降解。

PINK1

伴侣介导的自噬(CMA)

展示 Hsc70 识别 KFERQ 基序,以及底物通过 LAMP2A 转位进入溶酶体的伴侣介导自噬过程。

Hsc70

mTORC1 与 AMPK 自噬调控开关

展示代谢能量感知调控:营养充足时 mTORC1 抑制自噬,饥饿时 AMPK 激活 ULK1。

mTORC1

异噬与病原体清除

展示异噬通路中细胞内细菌的选择性泛素化,以及 p62/SQSTM1 介导的包裹过程。

Xenophagy

SNARE 与 HOPS 介导的自噬体融合

展示自噬体与溶酶体融合过程,包括 STX17、SNAP29、VAMP8 的反式 SNARE 配对及 Rab7 募集。

STX17/SNAP29
为何选择 SciDraw

为什么科研人员选择 SciDraw AI 绘制自噬通路图

SciDraw 可用于起草科学图示。使用前请根据来源材料核对标签、关系和主张。

工作需求
SciDraw AI
通用图像生成工具
科学实体与蛋白复合物呈现
规范排布经典蛋白复合物、磷酸化位点与清晰可读的基因/蛋白命名。
常生成不存在的蛋白结构、虚构基因符号或难以辨认的伪文字。
生化箭头语义与细胞区室边界
严格区分激活箭头(→)、抑制横杠(⊣)以及细胞器膜拓扑边界。
箭头方向随意,缺乏细胞器膜边界及明确的正负调控区分。
SVG 与 PowerPoint 后期可编辑性
支持导出分层 SVG 矢量图与包含独立可编辑文本框的 PowerPoint(PPTX)幻灯片。
仅输出扁平化像素图,文字拼写错误或排版问题无法直接修改。
适配期刊配图与学术汇报输出
原生支持 16:9 宽屏构图、2K/4K 导出,并可一键衔接科研视频摘要动画。
画幅比例不稳定且分辨率偏低,往往需要在其他软件中重新绘制。
实用指南

自噬通路图绘制与发表指南

遵循科学可视化原则,提升图示的准确性和可读性,并对照目标期刊的最新投稿要求进行检查。

自噬体与溶酶体融合图,展示 STX17、SNAP29、VAMP8 反式 SNARE 配对和 Rab7 募集

自噬通量中的关键生化复合物

严谨的自噬通路图应清楚区分上游营养感知调控层(mTORC1 和 AMPK)与下游结构装置。可突出 ULK1 激酶核心复合物(ULK1、ATG13、FIP200、ATG101)在内质网 omegasome 启动成核的作用,并呈现 class III PI3K 复合物(VPS34、Beclin-1、ATG14)生成 PI3P 脂质平台的过程。

  • 起始复合物:ULK1、ATG13、FIP200、ATG101
  • 成核平台:VPS34、Beclin-1、ATG14、VPS15 生成 PI3P
  • 泛素样连接系统:ATG12–ATG5–ATG16L1 复合物及 LC3-PE 脂化
  • 融合装置:STX17–SNAP29–VAMP8 SNARE 复合物、Rab7 和 HOPS 复合物
经典巨自噬通路图,展示吞噬泡成核、延伸、自噬体闭合和溶酶体融合

细胞降解过程的图示规范

Autophagy、Cell 和 Nature Cell Biology 等同行评审期刊要求清楚区分细胞质前体形式(LC3-I)与脂质结合、位于膜上的形式(LC3-II)。绘制双层膜吞噬泡时可使用典型的弯月形结构,并区分货物包裹过程与内体、多泡体之间的交互。

  • 用两条清晰的膜线区分未成熟吞噬泡和闭合的自噬体
  • 使用含义明确的箭头表示酶促脂化和分子募集级联
  • 标出 mTORC1 在 ULK1 Ser757 位点磷酸化对应的抑制线
  • 用不同符号表示 p62/SQSTM1、NBR1 和 OPTN 等选择性自噬受体
异噬通路图,展示细胞内细菌的选择性泛素化和 p62/SQSTM1 介导的包裹

期刊投稿前核对清单

在图注中写出所有缩写的全称。确认溶酶体酸性水解酶(cathepsin B、D、L)位于单层膜自噬溶酶体内部,环境 pH 为 4.5–5.0;并确认氨基酸、脂肪酸等代谢回收产物通过相应转运蛋白进入细胞质。

  • 核对膜结构:自噬体为双层膜,溶酶体和自噬溶酶体为单层膜
  • 核对自噬通量标志物(LC3-II 累积和 p62 降解)是否与实验 Western blot 结果一致
  • 确保文字对比度充足,在单栏(85 mm)和 1.5 栏(120 mm)印刷宽度下仍易读
PINK1-Parkin 介导的线粒体自噬图,展示线粒体去极化、泛素标记和选择性降解

4. 面向期刊投稿与学术汇报的多格式导出与排版优化

同一张通路或机制图常需兼顾论文双栏配图、16:9 学术会议幻灯片及基金申请书。合理规划视觉层级,可确保在不同媒介下均保持清晰可读:

  • 导出分层 SVG 矢量图或原生 PPTX 幻灯片,根据目标期刊或会场屏幕灵活调整字号、箭头粗细与配色方案。
  • 在多面板组合图中保持一致的色彩编码,使上游刺激、活性复合物与抑制剂一目了然。
  • 在正式投稿或汇报前,对照原始实验数据与权威文献核验所有基因符号、修饰位点与因果箭头。

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感言

为什么研究人员在他们的工作流程中保留 SciDraw

研究人员、研究生和教育工作者分享 SciDraw 如何帮助他们更快地创建科研配图、科研配图、图文摘要 (Graphical Abstract)和更清晰的教学视觉效果。

对于植物细胞讲座,我需要在不重建旧幻灯片的情况下调用叶绿体和液泡。 SciDraw 为我提供了一个有用的科研配图布局,仅经过几次标签编辑后就进入了我的幻灯片。

海伦·万斯博士

海伦·万斯博士

细胞生物学教授

当学生要求提供教科书之外的力图示例时,我会打开 SciDraw,而不是在幻灯片上重新绘制一个。这是我首先使用的科研配图生成器,然后我快速检查每个向量。

哈维尔·奥尔特加博士

哈维尔·奥尔特加博士

物理教师

对于资助提案,我们在任何人开始完善科学数据之前使用 SciDraw 就实验设置图达成一致。它减少了来回的次数,并从第一天起就为团队提供了共享的视觉效果。

德文德拉·维尔马博士

德文德拉·维尔马博士

研究实验室主任

在确定一个之前,我可以比较一些生物信号通路图作为学习笔记。

阮明

阮明

理科研究生

在我的论文中,我从 SciDraw 中的神经通路和突触布局开始从手稿到图形的过程。它为我提供了强大的第一构图,因此我可以将插画师的时间花在重要的细节上。

安纳尼亚·拉奥博士

安纳尼亚·拉奥博士

博士生·神经科学

第一张科研配图纸让我们的分馏设计审查立即启动。

马库斯·戴维斯博士

马库斯·戴维斯博士

化学工程主管

如果库存图像与该周的气候主题不匹配,我会在 SciDraw 中制作一个快速图表。它为全班提供了适合讨论的视觉效果,我可以根据他们的水平定制标签。

赵美玲教授

赵美玲教授

环境科学教育家

FAQ

常见问题

自噬通路图生成器 | SciDraw